Il secondo sito storico più visitato in Egitto dopo le piramidi. La differenza fondamentale tra Karnak e la maggior parte degli altri templi, consiste nell'impressionante durata del periodo di costruzione del tempio e suo utilizzo come luogo di culto. La costruzione del complesso templare iniziò nel Medio Regno e si protrasse fino all'epoca Tolemaica. Circa trenta faraoni contribuirono alla realizzazione degli edifici, che raggiunsero dimensioni, complessità e diversità mai viste prima.
La storia del complesso di Karnak è in gran parte la storia di Tebe e del suo ruolo in evoluzione nella civiltà Egizia. I centri di culto variavano a seconda delle varie regioni e, quando veniva istituita una nuova capitale all'interno della cultura organizzata, i centri religiosi di tale area acquisivano importanza. La città di Tebe non sembra essere stata di grande rilievo prima dell'Undicesima dinastia e la costruzione dei templi in precedenza sarebbe stata relativamente modesta, con santuari dedicati alle prime divinità di Tebe, le dee della Terra Mut e Montu.
Il nucleo originale fu distrutto dagli invasori. Il primo manufatto noto rinvenuto nell'area del tempio è una piccola colonna a otto lati dell'XI dinastia, che menziona Amun-Re. Amon (talvolta chiamato Amen) fu a lungo la divinità tutelare locale di Tebe. Era identificato con l'ariete e l'oca. Il significato egizio di Amun è "nascosto" o "dio nascosto".